Главная · Тег
Биоинформатика
Биоинформатика в экосистеме Claude Code: 53 инструмента — 50 скиллов, 2 MCP-сервера, 1 плагин. Популярные: QC одноклеточной РНК Anthropics, scvi-tools Anthropics, разработка Nextflow Anthropics. У каждого — описание на русском, команда установки и ссылка на исходники.
single-cell-rna-qcOfficial — QC одноклеточной РНК Anthropics
anthropics/knowledge-work-plugins
QC одноклеточных РНК-данных.
scvi-toolsOfficial — scvi-tools Anthropics
anthropics/knowledge-work-plugins
scvi-tools для одноклеточного анализа.
nextflow-developmentOfficial — разработка Nextflow Anthropics
anthropics/knowledge-work-plugins
Разработка Nextflow.
scikit-bio — scikit-bio K-Dense
k-dense-ai/scientific-agent-skills
scikit-bio для биоинформатики.
gget — gget K-Dense научный
k-dense-ai/scientific-agent-skills
gget K-Dense.
anndata — single-cell геномика AnnData матрица
k-dense-ai/scientific-agent-skills
Для single-cell геномики: работа с аннотированными матрицами данных AnnData.
scanpy — Scanpy K-Dense
k-dense-ai/scientific-agent-skills
Scanpy для анализа одноклеточных данных.
deeptools — DeepTools биоинформатика анализ
k-dense-ai/scientific-agent-skills
DeepTools для биоинформатики.
pydeseq2 — PyDESeq2 K-Dense
k-dense-ai/scientific-agent-skills
PyDESeq2 для дифференциальной экспрессии генов.
cellxgene-census — CellxGene Census биоинформатика данные клетки
k-dense-ai/scientific-agent-skills
CellxGene Census для биоинформатики и данных клеток.
esm — ESM эволюционная масштабирование модель
k-dense-ai/scientific-agent-skills
ESM эволюционная модель.
pysam — PySam K-Dense
k-dense-ai/scientific-agent-skills
PySam для работы с SAM/BAM.
diffdock — DiffDock молекулярный докинг
k-dense-ai/scientific-agent-skills
DiffDock молекулярный докинг.
scvi-tools — scvi-tools K-Dense
k-dense-ai/scientific-agent-skills
scvi-tools для одноклеточного анализа.
arboreto — GRN вывод регуляторных сетей генов
k-dense-ai/scientific-agent-skills
Python библиотека Aerts Lab для вывода регуляторных сетей генов из данных экспрессии.
dhdna-profiler — профилировщик ДНК научный агент
k-dense-ai/scientific-agent-skills
Профилировщик ДНК.
polars-bio — Polars-bio K-Dense научный
k-dense-ai/scientific-agent-skills
Polars-bio.
scvelo — scVelo K-Dense научный
k-dense-ai/scientific-agent-skills
scVelo для RNA velocity.
tiledbvcf — TileDB-VCF K-Dense научный
k-dense-ai/scientific-agent-skills
TileDB-VCF для геномных данных.
lamindb — LaminDB K-Dense научный
k-dense-ai/scientific-agent-skills
LaminDB.
etetoolkit — ETE Toolkit биоинформатика дерево
k-dense-ai/scientific-agent-skills
ETE Toolkit для деревьев.
dnanexus-integration — интеграция DNAnexus научный агент
k-dense-ai/scientific-agent-skills
Интеграция с DNAnexus.
latchbio-integration — интеграция LatchBio K-Dense научный
k-dense-ai/scientific-agent-skills
Интеграция LatchBio.
alphafold-database — AlphaFold 200M структур белков
davila7/claude-code-templates
Программный доступ к базе 200+ миллионов AI-предсказанных структур белков AlphaFold.